O Comitê Olímpico do Brasil realizou em maio de 2015 o II Congresso Brasileiro de Esporte Escolar e, atendendo sugestões dos participantes do judô e em acordo com a CBJ, decidiu que a partir da edição dos Jogos Escolares da Juventude 2016 a competição por equipes será dividida em duas categorias de acordo com a classificação final dos eventos de 2015.
A primeira divisão em 2016 será composta pelas oito primeiras equipes classificadas em 2015 e a segunda divisão pelas demais equipes e cidade sede. Os campeões e vice-campeões da segunda divisão irão integrar a primeira divisão no ano seguinte, e os classificados em sétimo e oitavo lugares na primeira divisão irão integrar a segunda divisão no ano seguinte.
As unidades Federativas que não participarem da edição de 2015 estarão automaticamente alocadas na segunda divisão em 2016. A delegação da cidade sede sempre estará alocada na segunda divisão, não tendo direito a acesso a primeira divisão.
